Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y5

CAMSAP3, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMSAP3Q9P1Y5 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAMSAP3Q9P1Y5 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms