Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TBCCD1Q9NVR7 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms