Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FBXO28Q9NVF7 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FBXO28Q9NVF7 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FBXO28Q9NVF7 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FBXO28Q9NVF7 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FBXO28Q9NVF7 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FBXO28Q9NVF7 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO28Q9NVF7 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO28Q9NVF7 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO28Q9NVF7 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO28Q9NVF7 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO28Q9NVF7 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO28Q9NVF7 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO28Q9NVF7 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO28Q9NVF7 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO28Q9NVF7 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO28Q9NVF7 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO28Q9NVF7 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO28Q9NVF7 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO28Q9NVF7 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO28Q9NVF7 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO28Q9NVF7 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO28Q9NVF7 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO28Q9NVF7 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO28Q9NVF7 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO28Q9NVF7 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO28Q9NVF7 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO28Q9NVF7 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO28Q9NVF7 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO28Q9NVF7 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO28Q9NVF7 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO28Q9NVF7 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO28Q9NVF7 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO28Q9NVF7 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO28Q9NVF7 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO28Q9NVF7 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO28Q9NVF7 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO28Q9NVF7 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO28Q9NVF7 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO28Q9NVF7 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO28Q9NVF7 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO28Q9NVF7 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO28Q9NVF7 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO28Q9NVF7 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO28Q9NVF7 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO28Q9NVF7 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FBXO28Q9NVF7 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FBXO28Q9NVF7 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FBXO28Q9NVF7 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FBXO28Q9NVF7 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FBXO28Q9NVF7 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FBXO28Q9NVF7 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FBXO28Q9NVF7 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FBXO28Q9NVF7 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FBXO28Q9NVF7 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO28Q9NVF7 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO28Q9NVF7 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO28Q9NVF7 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO28Q9NVF7 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO28Q9NVF7 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO28Q9NVF7 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO28Q9NVF7 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO28Q9NVF7 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO28Q9NVF7 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO28Q9NVF7 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO28Q9NVF7 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO28Q9NVF7 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO28Q9NVF7 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO28Q9NVF7 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO28Q9NVF7 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO28Q9NVF7 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO28Q9NVF7 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO28Q9NVF7 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO28Q9NVF7 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO28Q9NVF7 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO28Q9NVF7 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO28Q9NVF7 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO28Q9NVF7 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO28Q9NVF7 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO28Q9NVF7 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO28Q9NVF7 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO28Q9NVF7 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO28Q9NVF7 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO28Q9NVF7 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO28Q9NVF7 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO28Q9NVF7 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO28Q9NVF7 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO28Q9NVF7 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO28Q9NVF7 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO28Q9NVF7 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO28Q9NVF7 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO28Q9NVF7 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO28Q9NVF7 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO28Q9NVF7 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO28Q9NVF7 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO28Q9NVF7 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXO28Q9NVF7 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXO28Q9NVF7 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXO28Q9NVF7 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXO28Q9NVF7 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms