Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED17Q9NVC6 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms