Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG7

SIRT3, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-3, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT3Q9NTG7 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIRT3Q9NTG7 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms