Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ40

SLC52A3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A3Q9NQ40 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC52A3Q9NQ40 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms