Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 WISP3-201ENST00000230529 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 TAS2R7-201ENST00000240687 1096 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 CCL21-201ENST00000259607 852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 SSX2-201ENST00000336777 1410 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 FARP1-202ENST00000376581 1021 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPL12P29-201ENST00000425565 457 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL031767.1-201ENST00000426374 386 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC009227.2-201ENST00000432599 511 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 RBMX2P1-201ENST00000454795 836 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 CASP12-211ENST00000508062 774 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 C4orf19-203ENST00000508175 828 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC109458.1-201ENST00000508858 316 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC007106.1-201ENST00000509666 600 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC022140.1-201ENST00000511029 565 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 PEX2-204ENST00000520103 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC002428.1-201ENST00000523722 771 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC005840.3-201ENST00000541888 1803 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 MTCO1P2-201ENST00000554243 703 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 CHEK2P2-201ENST00000554701 672 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 OTX2-206ENST00000555006 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 CCL2-202ENST00000580907 736 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC02028-206ENST00000593326 810 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP001442.1-206ENST00000600590 1573 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC124944.3-201ENST00000607976 1304 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 SSX2B-203ENST00000612490 1410 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 ARHGAP44-212ENST00000616670 884 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 LYRM2-211ENST00000626778 696 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC090061.1-202ENST00000502102 1449 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
KRTAP9-4Q9BYQ2 HLA-DOB-206ENST00000438763 1372 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms