Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD9

ACTRT3, Actin-related protein T3, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT3Q9BYD9 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTRT3Q9BYD9 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms