Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms