Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 AL390728.6-201ENST00000566446 1246 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SSBP4Q9BWG4 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms