Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP58Q9BVL2 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP58Q9BVL2 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms