Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG9

PTDSS2, Phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2Q9BVG9 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTDSS2Q9BVG9 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms