Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB2BQ9BVA1 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms