Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNPPD1Q9BV87 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms