Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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KCNS3Q9BQ31 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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KCNS3Q9BQ31 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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KCNS3Q9BQ31 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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KCNS3Q9BQ31 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNS3Q9BQ31 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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