Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HOPXQ9BPY8 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms