Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD5Q99717 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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