Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCLRE1CQ96SD1 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms