Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms