Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms