Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC7Q96M83 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms