Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms