Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SHDQ96IW2 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SHDQ96IW2 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms