Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ5

CLIP3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP3Q96DZ5 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms