Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms