Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG8

CTHRC1, Collagen triple helix repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTHRC1Q96CG8 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTHRC1Q96CG8 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms