Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRG4Q92954 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms