Protein–RNA interactions for Protein: Q92935

EXTL1, Exostosin-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL1Q92935 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXTL1Q92935 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms