Protein–RNA interactions for Protein: Q92485

SMPDL3B, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3BQ92485 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPDL3BQ92485 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms