Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM41Q8WV44 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms