Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NEDD1Q8NHV4 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms