Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AVL9Q8NBF6 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms