Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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CLIP4Q8N3C7 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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CLIP4Q8N3C7 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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