Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKL3Q8IVW4 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms