Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC84Q86UT8 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms