Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDZRN4Q6ZMN7 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms