Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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