Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZCCHC12Q6PEW1 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms