Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED27Q6P2C8 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED27Q6P2C8 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED27Q6P2C8 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED27Q6P2C8 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED27Q6P2C8 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED27Q6P2C8 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED27Q6P2C8 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED27Q6P2C8 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED27Q6P2C8 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED27Q6P2C8 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MED27Q6P2C8 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED27Q6P2C8 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED27Q6P2C8 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED27Q6P2C8 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED27Q6P2C8 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED27Q6P2C8 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED27Q6P2C8 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED27Q6P2C8 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED27Q6P2C8 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED27Q6P2C8 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED27Q6P2C8 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED27Q6P2C8 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED27Q6P2C8 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED27Q6P2C8 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED27Q6P2C8 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED27Q6P2C8 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED27Q6P2C8 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED27Q6P2C8 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED27Q6P2C8 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED27Q6P2C8 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED27Q6P2C8 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED27Q6P2C8 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED27Q6P2C8 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED27Q6P2C8 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED27Q6P2C8 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED27Q6P2C8 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MED27Q6P2C8 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED27Q6P2C8 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED27Q6P2C8 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MED27Q6P2C8 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MED27Q6P2C8 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MED27Q6P2C8 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED27Q6P2C8 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED27Q6P2C8 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED27Q6P2C8 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED27Q6P2C8 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED27Q6P2C8 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED27Q6P2C8 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED27Q6P2C8 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED27Q6P2C8 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MED27Q6P2C8 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED27Q6P2C8 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED27Q6P2C8 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED27Q6P2C8 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED27Q6P2C8 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED27Q6P2C8 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED27Q6P2C8 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED27Q6P2C8 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED27Q6P2C8 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MED27Q6P2C8 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MED27Q6P2C8 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MED27Q6P2C8 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MED27Q6P2C8 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MED27Q6P2C8 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MED27Q6P2C8 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MED27Q6P2C8 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MED27Q6P2C8 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MED27Q6P2C8 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MED27Q6P2C8 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED27Q6P2C8 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms