Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR3

TYW3, tRNA wybutosine-synthesizing protein 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYW3Q6IPR3 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms