Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms