Protein–RNA interactions for Protein: Q66K66

TMEM198, Transmembrane protein 198, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM198Q66K66 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMEM198Q66K66 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM198Q66K66 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM198Q66K66 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM198Q66K66 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM198Q66K66 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM198Q66K66 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM198Q66K66 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM198Q66K66 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM198Q66K66 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM198Q66K66 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM198Q66K66 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM198Q66K66 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM198Q66K66 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms