Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BROXQ5VW32 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms