Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TDRD12Q587J7 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms