Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL12Q53G59 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL12Q53G59 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms