Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM259Q4ZIN3 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms