Protein–RNA interactions for Protein: Q495N2

SLC36A3, Proton-coupled amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A3Q495N2 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC36A3Q495N2 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms