Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NBPF8Q3BBV2 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms