Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KNOP1Q1ED39 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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