Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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RTL8BQ17RB0 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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RTL8BQ17RB0 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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RTL8BQ17RB0 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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RTL8BQ17RB0 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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RTL8BQ17RB0 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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RTL8BQ17RB0 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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RTL8BQ17RB0 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
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RTL8BQ17RB0 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
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